La siguiente tabla contiene una lista de los gobernantes que tuvo Centroamérica desde su independencia (1821) hasta la disolución de la República Federal (1839).
| Gobernante | Periodo | Otros datos |
| Gabino Gaínza y Fernández de Medrano | Jefe Político Superior y Presidente de la Junta Provisional Consultiva 1821-1822 | |
| Vicente Filisola | Jefe Político Superior, nombrado por el Imperio Mexicano 1822-1823 | |
| José Matías Delgado y León | Presidente de la Asamblea Nacional Constituyente de las Provincias Unidas del Centro de América 1823 | |
| Primer Triunvirato | 1823 | |
| Segundo Triunvirato, integrado por Manuel José Arce, Tomás Antonio O’Horán y Argüello y José Cecilio del Valle | 1823-1825 | |
| Manuel José de Arce y Fagoaga | Presidente de la República, elegido por el Congreso 1825-1829 | En 1828 llamó a ejercer temporalmente al Vicepresidente Beltranena, quien después se negó a devolverle el mando |
| Mariano Beltranena y Llano | Asumió el Ejecutivo como Vicepresidente de la República 1828-1829; derrocado en 1829 | |
| Francisco Morazán | Tomó el poder y a poco lo entregó al Senador designado por el Congreso 1829 | |
| José Francisco Barrundia y Cepeda | Senador encargado de la Presidencia 1829-1830 | |
| José Francisco Morazán Quezada | Presidente elegido por el Congreso para el período 1830-1834 | Durante su gobierno la capital federal se trasladó de Guatemala a Sonsonate y después a San Salvador |
| José Cecilio del Valle | Presidente elegido para el período 1834-1838 | Murió antes de tomar posesión |
| José Gregorio Salazar y Castro | Vicepresidente encargado del Ejecutivo 1834-1835 | |
| José Francisco Morazán Quezada | Presidente elegido para el período 1835-1839 | En 1838 se separaron sucesivamente de la Federación los Estados de Nicaragua, Honduras y Costa Rica |
| Diego Vigil y Cocaña | Vicepresidente encargado del Ejecutivo 1839 | La Federación se disolvió definitivamente |
